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看看南开大学学生的效率- 武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析

2020-01-22 | 作者:www.paper120.net  

        看看南开大学学生的销量-武汉冠状病毒已经发论文了 ,时间紧迫,还包含了知网查重的时间。太厉害了。

2019年12月,中国武汉报道了冠状病毒引起的肺炎,其临床症状与2003年爆发的严重急性呼吸综合征(Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS)不同,因此推断该病毒可能是冠状病毒的一个新变种。不同于简单使用全基因组序列的其它研究,我们于2018年在国际上首次提出分子功能与进化分析相结合的研究思想,并应用于冠状病毒基因组的研究。在这一思想指导下,本研究使用beta冠状病毒基因组中的一个互补回文序列(命名为Nankai complemented palindrome)与其所在的编码区(命名为NankaiCDS)对新发布的武汉2019冠状病毒基因组(GenBank:MN908947)进行分析以期准确溯源,并对beta冠状病毒的跨物种传播和宿主适应性进行初步研究。溯源分析的结果支持武汉2019冠状病毒源自中华菊头蝠,但与SARS冠状病毒差异巨大,这一结果与两者临床症状差异一致。本研究的最重要发现是beta冠状病毒存在大量的可变翻译,从分子水平揭示了该病毒变异快、多样性高的特点,为beta冠状病毒的防控提供了依据。从beta冠状病毒可变翻译中获取的信息可应用于... 更多

天津市重点研发计划科技支撑重点项目(南开大学,No.19YFZCSY00500);

冠状病毒; SARS; 可变翻译; 跨物种传播; 宿主适应性;

R373;Q811.4

武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析

陈嘉源1,施劲松2,丘栋安3,刘畅4,李鑫1,赵强1,阮吉寿5,高山1




1.南开大学 生命科学学院, 天津 300071;2.东部战区总医院, 南京 210016; 3.英国诺丁汉特伦特大学 生物科学系, 诺丁汉 NG11 8NS; 4.南开大学 医学院, 天津 300071; 5.南开大学 数学科学学院, 天津 300071)


摘要:

2019年12月,中国武汉报道了冠状病毒引起的肺炎,其临床症状与2003年爆发的严重急性呼吸综合征(Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS)不同,因此推断该病毒可能是冠状病毒的一个新变种。不同于简单使用全基因组序列的其它研究,我们于2018年在国际上首次提出分子功能与进化分析相结合的研究思想,并应用于冠状病毒基因组的研究。在这一思想指导下,本研究使用 beta 冠状病毒基因组中的一个互补回文序列(命名为 Nankai complemented palindrome)与其所在的编码区(命名为 Nankai CDS)对新发布的武汉2019冠状病毒基因组(GenBank: MN908947)进行分析以期准确溯源,并对beta冠状病毒的跨物种传播和宿主适应性进行初步研究。溯源分析的结果支持武汉2019冠状病毒源自中华菊头蝠,但与SARS冠状病毒差异巨大,这一结果与两者临床症状差异一致。本研究的最重要发现是beta冠状病毒存在大量的可变翻译,从分子水平揭示了该病毒变异快、多样性高的特点,为 beta 冠状病毒的防控提供了依据。从 beta 冠状病毒可变翻译中获取的信息可应用于(但不限于)其快速检测、基因分型、疫苗开发以及药物设计。另外,我们推断beta冠状病毒可能通过可变翻译以适应不同宿主。本研究是基于大量基因组数据的实证分析,在国际上首次从分子水平尝试解释了beta冠状病毒变异快、宿主多且具有较强的宿主适应性的原因。


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